По просочившимся в прессу сведениям, Совет Европы остался недоволен законом, так как считает, что он по ряду пунктов нарушает Европейскую конвенцию по правам человека. В Страсбурге подчеркивают, что контроль государства над НПО, установленный законом, является чрезмерным и представляет собой узаконенную дискриминацию иностранных НПО, которые будут находиться в худших условиях, чем российские. По мнению наблюдателей, подобная критика может послужить поводом для многих НПО подать на Россию иск в Европейский суд по правам человека.
