Согласно указу, это сделано "в целях реализации единой государственной политики, сохранения и развития исторических традиций в области геральдики". Флаг директора ФСБ будет представлять собой "светло-зеленое прямоугольное полотнище с гюйсом (военно-морской красный флаг с синим Андреевским крестом) в крыже (часть полотнища у древка)". В нижней части правой половины полотнища расположено многоцветное изображение Государственного герба РФ.
