На родине в отношении Атовуллоева еще в 2000-е годы были заведены уголовные дела (его обвинили в оскорблении президента и призывах к свержению власти). Власти Таджикистана обращались к России, где проживал оппозиционер, с просьбой его экстрадировать. Однако просьба не была удовлетворена. Атовуллоева несколько раз задерживали в Москве, но до выдачи его Таджикистану дело не доходило.
Недавно оппозиционер появился в эфире телеканала «К+». В передаче были показаны ролики со свадьбы сына президента Таджикистана. На записях президент Эмомали Рахмон поет и танцует. Атовуллоев выступил с критическими комментариями в отношении главы республики. Он утверждал, что видео получил от председателя Комитета по телевидению и радиовещанию Таджикистана Асадулло Рахмонова. Последний свою причастность к распространению роликов опроверг. Из-за комментариев Атовуллоева в Таджикистане был заблокирован телеканал K+ и закрыт доступ к YouTube.
Дододжон Атовуллоев покинул Таджикистан в начале 1990-х годов. Он, как и многие сограждане, обосновался в Москве, хотя время от времени выезжал за рубеж. Несколько лет назад оппозиционер объявил о создании движения «Ватандор» («Соотечественник»), призванного добиться смены власти в Таджикистане. Атовуллоев утверждал, что его родина «беременна революцией».
В начале 2012 года на Атовуллоева в Москве было совершено нападение. Неизвестный несколько раз ударил его ножом. Оппозиционер тогда утверждал, что покушение имеет политическую подоплеку.
