Известно, что Николайчук не мог ужиться с областными властями в лице губернатора Сергея Жвачкина. Внешне стороны расстались без претензий, дипломатические приличия соблюдены. Николайчук, выступая перед думой, позитивно оценил то, что делается в Томске в плане благоустройства и реализации крупных инвестпроектов. Он отметил, что по удобству ведения бизнеса этот город в последнее время занимает четвертое место в России. В то же время он отметил, что "именно сейчас Томск стоит на пороге главного решения - как он будет развиваться дальше".
"Многие горожане почувствовали, что есть напряжение между городской и областной властью. Ситуация еще не переросла в конфликт, но уже сказывается на решении ключевых вопросов", - заметил мэр.
По мнению Николайчука, со сменой региональной власти в области 1,5 года назад произошла кардинальная смена курса, и с этим новым курсом он не согласен. "Я не разделяю идеи превращения Томска из научно-образовательного центра в центр сырьевых компаний. Продолжение моей работы на посту мэра неизбежно приведет к конфликту. Город не должен становиться заложником такой ситуации. Единственно верное решение для меня - уйти в отставку", - заявил Николайчук.
Губернатор Жвачкин мэра за уход с должности похвалил. Он назвал добровольную отставку "мужским поступком". Депутаты гордумы с отставкой мэра тоже согласились, но выдвинули ряд своих претензий. Бывший глава городского Департамента капитального строительства Владимир Оккель заявил, например, что Николайчук виноват в развале дорожно-строительной отрасли и плохой работе муниципальных компаний: "Могу говорить только про дорожную отрасль, здесь вина мэра очевидна. Местные дорожные предприятия отодвинуты от муниципальных заказов. Все крупные работы выполняют иногородние компании. На улицах бардак. И за это тоже Николайчук несет ответственность". Депутат Александр Деев заявил, что муниципальный долг вырос за годы правления Николайчука с 640 миллионов рублей до 2 миллиардов 680 миллионов рублей.
Вероятно, претензии к мэру грозили вот-вот перерасти в полноценное скандальное расследование. Перед глазами у Николайчука стоит судьба предыдущего главы Томска Александра Макарова. Он был приговорен к 12 годам колонии после ареста в декабре 2006 года по подозрению в должностных преступлениях и взяточничестве. По данным «МК», решение Николайчук принял после ареста ярославского мэра Евгения Урлашова, который также конфликтовал с областными властями.
