Соответствующий пакет поправок в действующее законодательство размещен на сайте службы и направлен на согласование ведомств.
В частности, при проведении ветеринарного, фитосанитарного или транспортного контроля ФТС предлагает передать непосредственную проверку документов таможенникам. По результатам контроля сотрудник ФТС должен принять решение о возможности пропуска товаров или транспортных средств.
Поправками предусматривается установление специализированных пунктов пропуска для ввозимых в РФ автомобилей и продукции, подлежащих карантинному контролю.
В случае одобрения документ вступит в силу с 1 июля 2010 года. ФТС также отмечает, что в случае передачи полномочий потребуются дополнительные расходы из бюджета на переоборудование пунктов пропуска, переподготовку таможенников.
На данный момент служба вправе осуществлять на границе фитосанитарный и ветеринарный контроль. Соответствующее постановление правительства РФ (N480) было подписано в июне 2008 года. Транспортный контроль на постах осуществляет Минтранс РФ, также на границе ведется пограничный контроль. Однако на практике представители Россельхознадзора работают в пунктах пропуска на наиболее загруженных направлениях.