Его доходы составили 124,372 млрд. рублей, а расходы — 128,212 млрд. рублей. Дефицит бюджета — 3,840 млрд. рублей. Бюджет, как и в предыдущие годы, был социально ориентированным. По сравнению с 2005 годом расходы на социально-культурную сферу выросли на 25,7 млрд. рублей. В основном эти средства были направлены на повышение оплаты труда работников бюджетной сферы, создание условий для доступности бесплатных услуг в области образования и здравоохранения, а также социальную поддержку различных категорий населения области. К концу 2006 года средняя заработная плата работников образования увеличилась на 40 процентов, здравоохранения — на 19 процентов, социальных работников — на 24 процента, работников учреждений культуры — почти на 26 процентов.
На капитальные расходы было направлено 23,2 млрд. рублей (18,1 процента общего объема расходов бюджета). Из них 11,6 млрд. рублей выделено на строительство, ремонт и реконструкцию объектов государственной собственности Московской области в сфере здравоохранения и спорта. На содержание, ремонт, реконструкцию, строительство и управление дорожным хозяйством было направлено 12,9 млрд. рублей. На эти деньги обеспечивалось рабочее состояние свыше 20 тысяч километров автомобильных дорог.
