Но, по нынешним меркам, Черкасов прожил совсем короткий век. После пятидесяти у артиста начались серьезные проблемы со здоровьем. Сказывалась невероятная нагрузка, нервная и физическая, которой невозможно избежать будучи так близко к власти и воплощая столь значительные образы. Режиссер Эйзенштейн вспоминал, как трудно было Черкасову выйти из образа Ивана Грозного на съемках. Даже когда звучала команда «Стоп», он продолжал играть: как бегун, который не может остановиться сразу у финишной черты. Настолько полным было актерское перевоплощение.
К 1963 году Черкасов не снимался уже пять лет. Он с радостью принял предложение сняться на любимом Ленфильме в картине «Все остается людям». Но худсовет неожиданно отклонил его пробы. «Черкасов – творческий труп», - сказали о нем. Тогда к «покойным» причисляли всех звезд сталинского кинематографа. Но Черкасова удалось отстоять. Он, несмотря на все звания и шлейф великих ролей, отдал всего себя и этой работе.
Никто из съемочной группы и не подозревал, что Черкасов был уже тяжело болен. В его легких диагнастировали эмфизему, актер страдал тяжелой отдышкой. Курение было под строгим запретом, но все же Николай Константинович стрелял сигаретки у съемочной группы и потихоньку курил в кулак.
После съемок Черкесов лег в больницу. Резко обострилась эмфизема, пошаливало сердце. Как раз в этот период ему был нанесен удар, который актер уже не пережил.
Летом 64-го года, перед открытием нового сезона в Ленинградский академический театр драмы (ныненшяя Александринка) пришло распоряжение сократить штат. Директор принял решение в первую очередь уволить жен артистов. Среди них была и неизменная спутница жизни Николая Черкасова – Нина Черкасова-Вейтбрехт. Актер со всей своей пылкостью принялся отстаивать супругу, но не смог. Его последним аргументом было собственное увольнение, которое в театре приняли. Так народный кумир и лауреат всех возможных советских премий оказался не у дел и практически изгнан из профессии.
14 сентября 1966 года Черкасова не стало. В последний путь актёра провожали тысячи ленинградцев. Сейчас его имя Черкасова носит улица в Санкт-Петербурге.
История не сохранила ни одного изображения Александра Невского. За неимением решили изображать князя с лицом Николая Черкасова. Таким он и выгравирован, например, на ордене, учрежденный в 1942 году.